转基因小鼠 （Transgenic mice） 是指基因组中随机整合入外源基因的小鼠。通常采用显微注射技术将外源 DNA 注射（或逆转录病毒介导等方法） 到一个受精卵细胞核中，使外源 DNA 随机整合到小鼠基因组中，产生带有外源基因的遗传性突变小鼠模型。目前常用 C57BL/6，ICR 等背景小鼠的受精卵建立转基因小鼠品系，出生的首代转基因阳性的小鼠称为 Founder 小鼠（F0 代） ， 由于 Founder 小鼠之间在外源基因插入位点和外源基因拷贝数等方面存在不同，因此每个Founder都将被视为一个独立的品系进行繁育，对每个 Founder 品系鉴定之后才能确立所需目的品系。利用转基因小鼠可研究某些基因的特异性表达（包括表达强度、表达时间、表达部位)对个体的影响，从而研究该基因以及相关基因的功能，常被用于建立人类疾病模型。