2019-04-29
当我们在文章里看到C57BL/6,C57BL/6J,BALB/c,BALB/c-nu/nu,FVB等不同命名小鼠,你是否知道它们的差异和联系呢,本期的内容小编就教教你如何认识五花八门的小鼠命名,定会让你受益。
题目:我的名字叫C57BL/6J,过年回家我和我堂妹C57BL/6NCrl吃面的时候碰到了表叔C57BL,偷偷的告诉我们,城里当官的堂妹小姨子的婶婶的舅姥爷B6会给我们发红包。
请问:假如我同学BALB/c和他女朋友C3H结婚以后生的孩子去Jackson lab工作两年以后叫什么名字?C57BL、B6、C57BL/6J、C57BL/6NCrl
哇哈哈,是不是有种题目还没读完就不知道谁是谁的感觉?心里阴影面积很大吗?你知道吗,其实这些字母和数字组合也都是我们最常见的小鼠模型。在本期结束以后,你将能够回答以上问题。
小鼠是生物医学研究领域中最常见的动物模型,我们在之前已为大家介绍过常见的大小鼠(链接)。上期我们又学习了在动物实验中应该如何善待它们(实验动物伦理学及福利)。当我们在文章里看到C57BL/6,C57BL/6J,BALB/c,BALB/c-nu/nu,FVB等不同命名小鼠,你是否知道它们的差异和联系呢,今天小编就带你一起来学习,小鼠的命名规则。
一个标准的命名规则对于实验动物的研究有重要意义,但是要完全熟悉不是一件容易的事情,但如果我们能够了解和掌握小鼠命名的基本规则,做到顾“名”而思“义”,那将对我们阅读文献及合适的动物品系的选择有很大帮助。目前通用的小鼠命名原则是根据小鼠标准化遗传命名国际委员会(International Committee on Standardized Genetic Nomenclature for mice)的规定。我们主要以此为参考依据,对各种不同品系小鼠的定义和命名规则做简要的阐述。
本次内容将根据小鼠的遗传背景分类来简单介绍小鼠的命名。
小鼠的分类: 一般生物实验中要求遗传背景明确或者来源清楚的动物,用于疾病动物模型主要有近交系、封闭群等。如下为小鼠分类及常见小鼠举例。
一、近交系
1、一般近交系(Inbred strain)
定义:经20代以上同胞兄弟姐妹之间或亲代与子代之间的交配培育出来的动物品系,遗传基因纯化度越高,可增加实验结果的精确度。
命名:根据小鼠的来源、历史及培育经过来命名。
类型:
备注:615(F25)表示615小鼠,近交代数为第25代。
常见近交系的缩写形式:
1.1 亚系(Substrain)
定义:为近交系的分支,由于残留杂合基因的分离、基因突变以及在不同地区繁育而造成同一品系内不同分支之间在遗传上有差异的动物。
命名:母品系(Parent strain)名称后加一斜线,数字和培育者的缩写。
备注:
① 数字: C57BL/6和C57BL/10 (1937年将C57BL分成2个亚系,即C57BL/6和C57BL/10);
② 字母:CBA/J, CBA品系之Jackson实验室(亚株实验室标号,通常第一字为大写)。
③ 数字及实验室注册标号二者混合:当一实验人员或实验室发展出一种以上之亚株时,如FL/1Re和FL/4Re。
常见的实验室缩写:
1.2 支系(subline)
定义:品系的分支,由于形成环境,母体或细胞质的不同,导致可能有遗传的不同者。
命名:品系或亚系名称之后加上@标号,其后再加上实验室注册号码。
举例:
还有用不同的标号表示不同的人为处理方式:
注:但现在已不使用此标示方法,除非它已成为一个确定之品系。
2. 同源突变近交系(Coisogenic inbred strain)
定义:两个近交系除了在一个确定位点等位基因不同外,其它遗传基因全部相同。
命名:发生突变的近交系和突变基因
举例:
注:小写字母表示隐性突变,大写字母表示显性突变;当突变基因必须以杂合予以形式保持时,用+代表野生型基因,如:A/Fa-+/c。
3. 同源导入近交系(Congenic inbred strain)
定义:是指通过杂交-互交和回交的方式将个体的一个基因导入到近交系中,由此形成一个新的近交系。这个新的近交系与原来的近交系只是在一个很小的染色体片段上的基因不同。
命名:
混合近交系:来自2个亲代品系,其中一个还未达到近交系状态。
命名:其命名是在背景品系名称之后加上提供品系(donor strain)名称, 二者间以“;”隔。
举例:
4. 重组近亲系 (Recombinant inbred strain)
定义:由2个近交系杂交,经过连续20代以上兄妹近亲交配而得不同的重组近亲品系。
命名:母系于前缩写,中间加上大写“X”,品系与 X 间无空格,父系于后。
举例:
二、 F1代杂合子(F1 Hybrids)
定义:两个不同的近交系动物杂交产生的第一代动物,常用F1来表示。是既具有近交系动物的遗传特点,又获得了杂交优势,生命力强,繁殖率高,生长快,体质强健,抗病力强等。它与近交系动物有着相同的实验效果。
命名:母系小鼠加父系小鼠,最后加F1。
举例:
三、封闭群/远交群(Outbred stock)
定义:以非近亲交配方式(如随机交配)的培育方法而得到的实验动物种群,相对于近交系动物其杂合性高,但又有较高的遗传基因稳定性,繁殖力强。
命名:A:B,A为实验室注册标号,B为鼠种符号。
举例:
四、基因突变品系
定义:由于某些动物的基因位点的自发突变,或人为修饰(基因敲除和敲入),而发生的一个同类突变品系。此类个体中具有同样的遗传缺陷或病症,如肥胖症、肿瘤鼠、白血病鼠、糖尿病鼠、高血压鼠等等。这些品系的动物在医学研究中有着极大的应用价值。
命名:
自发突变小鼠:
转基因小鼠:来自Jackson lab的C57BL/6J小鼠被转入人的CD8基因组,转基因是在Jwg实验室完成,获取得到的是序号为23的小鼠。
实验小鼠的命名是一个系统而复杂的工程,其中既有最新概念的更新,也有传统理念的延续。我们所做的只是一个简单的梳理,目的是希望能帮助小伙伴们get到“见到小鼠名字,基本知其含义”的效果,而要想更好地掌握这些知识,那就需要更多的学习和努力咯。
学习了这么多,不知道大家是否可以回答我们开头的问题呢,可以在下方为我们留言,我们期待你的答案哦!
参考资料:International Committee on Standardized Genetic Nomenclature for mice, 1993